Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX2P50458 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX2P50458 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX2P50458 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LHX2P50458 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX2P50458 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX2P50458 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX2P50458 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX2P50458 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX2P50458 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX2P50458 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX2P50458 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX2P50458 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX2P50458 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX2P50458 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX2P50458 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX2P50458 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX2P50458 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX2P50458 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX2P50458 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX2P50458 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX2P50458 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX2P50458 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX2P50458 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX2P50458 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX2P50458 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX2P50458 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX2P50458 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX2P50458 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX2P50458 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX2P50458 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX2P50458 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX2P50458 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX2P50458 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX2P50458 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX2P50458 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX2P50458 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX2P50458 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX2P50458 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX2P50458 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX2P50458 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX2P50458 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX2P50458 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX2P50458 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX2P50458 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX2P50458 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX2P50458 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX2P50458 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX2P50458 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX2P50458 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX2P50458 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX2P50458 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX2P50458 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX2P50458 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX2P50458 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX2P50458 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX2P50458 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX2P50458 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX2P50458 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX2P50458 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX2P50458 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX2P50458 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX2P50458 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX2P50458 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX2P50458 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX2P50458 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX2P50458 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX2P50458 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX2P50458 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX2P50458 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LHX2P50458 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LHX2P50458 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX2P50458 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX2P50458 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX2P50458 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX2P50458 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX2P50458 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX2P50458 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX2P50458 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX2P50458 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX2P50458 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX2P50458 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX2P50458 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX2P50458 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX2P50458 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX2P50458 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX2P50458 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX2P50458 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX2P50458 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX2P50458 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX2P50458 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX2P50458 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX2P50458 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX2P50458 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX2P50458 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX2P50458 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX2P50458 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX2P50458 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX2P50458 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX2P50458 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms