Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNTBP49356 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNTBP49356 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNTBP49356 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FNTBP49356 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNTBP49356 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNTBP49356 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FNTBP49356 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNTBP49356 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNTBP49356 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNTBP49356 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNTBP49356 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FNTBP49356 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNTBP49356 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNTBP49356 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNTBP49356 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNTBP49356 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNTBP49356 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNTBP49356 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FNTBP49356 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNTBP49356 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FNTBP49356 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FNTBP49356 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNTBP49356 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNTBP49356 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNTBP49356 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNTBP49356 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FNTBP49356 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FNTBP49356 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FNTBP49356 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNTBP49356 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNTBP49356 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNTBP49356 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNTBP49356 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNTBP49356 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNTBP49356 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNTBP49356 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNTBP49356 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNTBP49356 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNTBP49356 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNTBP49356 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNTBP49356 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNTBP49356 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNTBP49356 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNTBP49356 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FNTBP49356 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNTBP49356 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNTBP49356 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNTBP49356 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNTBP49356 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNTBP49356 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNTBP49356 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNTBP49356 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNTBP49356 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNTBP49356 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNTBP49356 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNTBP49356 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNTBP49356 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNTBP49356 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNTBP49356 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNTBP49356 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNTBP49356 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNTBP49356 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNTBP49356 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNTBP49356 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNTBP49356 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNTBP49356 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNTBP49356 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNTBP49356 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNTBP49356 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FNTBP49356 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNTBP49356 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNTBP49356 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FNTBP49356 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNTBP49356 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNTBP49356 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNTBP49356 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNTBP49356 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FNTBP49356 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNTBP49356 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNTBP49356 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNTBP49356 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNTBP49356 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNTBP49356 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNTBP49356 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNTBP49356 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FNTBP49356 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FNTBP49356 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNTBP49356 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNTBP49356 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNTBP49356 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNTBP49356 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNTBP49356 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNTBP49356 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNTBP49356 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNTBP49356 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNTBP49356 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNTBP49356 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNTBP49356 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNTBP49356 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms