Protein–RNA interactions for Protein: P48378

RFX2, DNA-binding protein RFX2, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX2P48378 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFX2P48378 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFX2P48378 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFX2P48378 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFX2P48378 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX2P48378 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX2P48378 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX2P48378 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX2P48378 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX2P48378 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX2P48378 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX2P48378 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX2P48378 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX2P48378 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX2P48378 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX2P48378 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX2P48378 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX2P48378 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX2P48378 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX2P48378 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX2P48378 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX2P48378 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX2P48378 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX2P48378 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX2P48378 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX2P48378 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX2P48378 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX2P48378 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX2P48378 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX2P48378 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX2P48378 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX2P48378 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX2P48378 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX2P48378 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX2P48378 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX2P48378 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX2P48378 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX2P48378 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX2P48378 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFX2P48378 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RFX2P48378 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFX2P48378 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX2P48378 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX2P48378 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX2P48378 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX2P48378 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX2P48378 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX2P48378 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX2P48378 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX2P48378 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX2P48378 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX2P48378 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX2P48378 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX2P48378 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX2P48378 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX2P48378 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX2P48378 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX2P48378 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX2P48378 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX2P48378 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX2P48378 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX2P48378 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX2P48378 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX2P48378 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX2P48378 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX2P48378 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX2P48378 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX2P48378 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX2P48378 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX2P48378 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX2P48378 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX2P48378 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX2P48378 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX2P48378 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX2P48378 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX2P48378 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX2P48378 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX2P48378 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX2P48378 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX2P48378 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX2P48378 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX2P48378 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX2P48378 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX2P48378 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX2P48378 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX2P48378 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX2P48378 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX2P48378 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX2P48378 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX2P48378 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFX2P48378 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX2P48378 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX2P48378 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX2P48378 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RFX2P48378 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX2P48378 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX2P48378 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX2P48378 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX2P48378 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RFX2P48378 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms