Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIA2P42262 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms