Protein–RNA interactions for Protein: P41240

CSK, Tyrosine-protein kinase CSK, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSKP41240 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CSKP41240 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSKP41240 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CSKP41240 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSKP41240 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSKP41240 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSKP41240 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSKP41240 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSKP41240 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSKP41240 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSKP41240 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSKP41240 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSKP41240 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSKP41240 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSKP41240 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSKP41240 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSKP41240 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSKP41240 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSKP41240 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSKP41240 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CSKP41240 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSKP41240 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSKP41240 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CSKP41240 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSKP41240 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSKP41240 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSKP41240 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSKP41240 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSKP41240 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CSKP41240 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSKP41240 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSKP41240 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CSKP41240 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSKP41240 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSKP41240 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSKP41240 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSKP41240 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSKP41240 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSKP41240 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CSKP41240 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSKP41240 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSKP41240 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSKP41240 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSKP41240 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSKP41240 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSKP41240 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSKP41240 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSKP41240 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSKP41240 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSKP41240 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSKP41240 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSKP41240 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CSKP41240 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSKP41240 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSKP41240 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSKP41240 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSKP41240 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSKP41240 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSKP41240 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CSKP41240 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSKP41240 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSKP41240 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSKP41240 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSKP41240 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSKP41240 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSKP41240 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSKP41240 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSKP41240 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CSKP41240 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSKP41240 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSKP41240 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSKP41240 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSKP41240 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CSKP41240 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSKP41240 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSKP41240 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSKP41240 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSKP41240 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CSKP41240 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSKP41240 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSKP41240 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSKP41240 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSKP41240 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSKP41240 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CSKP41240 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSKP41240 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSKP41240 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSKP41240 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSKP41240 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSKP41240 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSKP41240 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSKP41240 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CSKP41240 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSKP41240 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSKP41240 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSKP41240 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSKP41240 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSKP41240 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSKP41240 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CSKP41240 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms