Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPHP41219 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPHP41219 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPHP41219 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPHP41219 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPHP41219 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPHP41219 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPHP41219 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPHP41219 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPHP41219 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPHP41219 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPHP41219 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPHP41219 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPHP41219 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPHP41219 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPHP41219 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPHP41219 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPHP41219 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPHP41219 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PRPHP41219 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPHP41219 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPHP41219 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPHP41219 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRPHP41219 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPHP41219 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPHP41219 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPHP41219 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPHP41219 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPHP41219 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPHP41219 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPHP41219 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPHP41219 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPHP41219 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPHP41219 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPHP41219 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPHP41219 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPHP41219 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPHP41219 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPHP41219 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPHP41219 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPHP41219 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPHP41219 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRPHP41219 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRPHP41219 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPHP41219 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPHP41219 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPHP41219 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPHP41219 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPHP41219 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPHP41219 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPHP41219 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPHP41219 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPHP41219 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPHP41219 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPHP41219 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPHP41219 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPHP41219 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPHP41219 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPHP41219 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPHP41219 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPHP41219 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPHP41219 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPHP41219 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPHP41219 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPHP41219 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPHP41219 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPHP41219 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPHP41219 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPHP41219 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPHP41219 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPHP41219 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPHP41219 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPHP41219 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPHP41219 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPHP41219 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPHP41219 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPHP41219 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPHP41219 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPHP41219 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPHP41219 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPHP41219 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRPHP41219 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRPHP41219 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPHP41219 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPHP41219 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPHP41219 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPHP41219 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPHP41219 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPHP41219 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPHP41219 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPHP41219 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPHP41219 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPHP41219 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPHP41219 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPHP41219 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPHP41219 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPHP41219 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPHP41219 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPHP41219 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPHP41219 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239.6 ms