Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC26A3P40879 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC26A3P40879 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC26A3P40879 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC26A3P40879 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC26A3P40879 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC26A3P40879 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC26A3P40879 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC26A3P40879 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC26A3P40879 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC26A3P40879 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC26A3P40879 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC26A3P40879 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC26A3P40879 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC26A3P40879 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC26A3P40879 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC26A3P40879 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC26A3P40879 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC26A3P40879 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms