Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP12P39900 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP12P39900 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP12P39900 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP12P39900 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP12P39900 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP12P39900 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP12P39900 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP12P39900 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP12P39900 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP12P39900 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP12P39900 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP12P39900 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP12P39900 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP12P39900 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP12P39900 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP12P39900 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP12P39900 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP12P39900 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP12P39900 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP12P39900 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP12P39900 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP12P39900 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP12P39900 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP12P39900 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP12P39900 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP12P39900 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP12P39900 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP12P39900 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP12P39900 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP12P39900 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP12P39900 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP12P39900 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP12P39900 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP12P39900 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP12P39900 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP12P39900 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP12P39900 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP12P39900 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP12P39900 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP12P39900 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP12P39900 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP12P39900 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP12P39900 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP12P39900 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP12P39900 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP12P39900 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP12P39900 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP12P39900 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP12P39900 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP12P39900 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP12P39900 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP12P39900 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP12P39900 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP12P39900 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP12P39900 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP12P39900 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP12P39900 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP12P39900 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP12P39900 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP12P39900 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP12P39900 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP12P39900 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP12P39900 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP12P39900 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP12P39900 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP12P39900 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP12P39900 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP12P39900 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP12P39900 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP12P39900 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP12P39900 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP12P39900 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP12P39900 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP12P39900 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP12P39900 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP12P39900 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP12P39900 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP12P39900 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP12P39900 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP12P39900 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP12P39900 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP12P39900 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP12P39900 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP12P39900 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP12P39900 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP12P39900 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP12P39900 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP12P39900 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP12P39900 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP12P39900 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP12P39900 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP12P39900 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP12P39900 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP12P39900 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP12P39900 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP12P39900 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP12P39900 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP12P39900 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP12P39900 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms