Protein–RNA interactions for Protein: P35712

SOX6, Transcription factor SOX-6, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6P35712 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX6P35712 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX6P35712 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX6P35712 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX6P35712 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX6P35712 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX6P35712 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX6P35712 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX6P35712 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX6P35712 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX6P35712 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX6P35712 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX6P35712 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX6P35712 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX6P35712 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX6P35712 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX6P35712 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SOX6P35712 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX6P35712 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX6P35712 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX6P35712 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX6P35712 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX6P35712 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX6P35712 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX6P35712 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX6P35712 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX6P35712 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX6P35712 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX6P35712 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX6P35712 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX6P35712 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX6P35712 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX6P35712 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX6P35712 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX6P35712 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX6P35712 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX6P35712 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX6P35712 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX6P35712 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX6P35712 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX6P35712 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX6P35712 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX6P35712 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX6P35712 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX6P35712 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX6P35712 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SOX6P35712 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX6P35712 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX6P35712 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX6P35712 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX6P35712 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX6P35712 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX6P35712 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX6P35712 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX6P35712 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX6P35712 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX6P35712 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX6P35712 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX6P35712 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX6P35712 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX6P35712 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX6P35712 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX6P35712 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX6P35712 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX6P35712 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX6P35712 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX6P35712 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX6P35712 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX6P35712 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX6P35712 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX6P35712 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX6P35712 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX6P35712 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX6P35712 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX6P35712 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX6P35712 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX6P35712 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX6P35712 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX6P35712 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX6P35712 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX6P35712 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX6P35712 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX6P35712 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX6P35712 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX6P35712 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX6P35712 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX6P35712 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX6P35712 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX6P35712 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX6P35712 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX6P35712 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX6P35712 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX6P35712 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX6P35712 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SOX6P35712 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SOX6P35712 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX6P35712 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX6P35712 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX6P35712 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX6P35712 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms