Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCVRNP35243 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCVRNP35243 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
RCVRNP35243 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms