Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SFNP31947 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SFNP31947 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SFNP31947 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SFNP31947 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SFNP31947 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SFNP31947 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SFNP31947 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SFNP31947 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SFNP31947 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SFNP31947 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SFNP31947 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
SFNP31947 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SFNP31947 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SFNP31947 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SFNP31947 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SFNP31947 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SFNP31947 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SFNP31947 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SFNP31947 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SFNP31947 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SFNP31947 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SFNP31947 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SFNP31947 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SFNP31947 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SFNP31947 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SFNP31947 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SFNP31947 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SFNP31947 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SFNP31947 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SFNP31947 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SFNP31947 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SFNP31947 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SFNP31947 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SFNP31947 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SFNP31947 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SFNP31947 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SFNP31947 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SFNP31947 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SFNP31947 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SFNP31947 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SFNP31947 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SFNP31947 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SFNP31947 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SFNP31947 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SFNP31947 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SFNP31947 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SFNP31947 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SFNP31947 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SFNP31947 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFNP31947 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFNP31947 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFNP31947 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFNP31947 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SFNP31947 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SFNP31947 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SFNP31947 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SFNP31947 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SFNP31947 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SFNP31947 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SFNP31947 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SFNP31947 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFNP31947 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFNP31947 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SFNP31947 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFNP31947 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFNP31947 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFNP31947 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFNP31947 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFNP31947 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SFNP31947 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFNP31947 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SFNP31947 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SFNP31947 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SFNP31947 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SFNP31947 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SFNP31947 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SFNP31947 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SFNP31947 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SFNP31947 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SFNP31947 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SFNP31947 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SFNP31947 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SFNP31947 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SFNP31947 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SFNP31947 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SFNP31947 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SFNP31947 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SFNP31947 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SFNP31947 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SFNP31947 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SFNP31947 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SFNP31947 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SFNP31947 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SFNP31947 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SFNP31947 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SFNP31947 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SFNP31947 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SFNP31947 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SFNP31947 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms