Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 EIF4A1-234ENST00000584798 1440 nt8.72□□□□□ -1.011e-16■■■■■ 42.8
RPS3P23396 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.282e-11■■■■■ 42.7
RPS3P23396 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.13e-8■■■■■ 42.7
RPS3P23396 NDUFS4-203ENST00000506765 559 ntTSL 210.85□□□□□ -0.676e-7■■■■■ 42.7
RPS3P23396 NDUFS4-204ENST00000506974 833 ntTSL 1 (best)9.86□□□□□ -0.836e-7■■■■■ 42.7
RPS3P23396 NDUFS4-201ENST00000296684 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.876e-7■■■■■ 42.7
RPS3P23396 NDUFS4-202ENST00000502423 562 ntTSL 59.25□□□□□ -0.936e-7■■■■■ 42.7
RPS3P23396 NDUFS4-205ENST00000507026 680 ntTSL 38.11□□□□□ -1.116e-7■■■■■ 42.7
RPS3P23396 RAB21-201ENST00000261263 15546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.981e-13■■■■■ 42.5
RPS3P23396 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.119e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 GLRX3-203ENST00000481034 1921 ntTSL 1 (best)21.05■□□□□ 0.969e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.682e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.342e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.312e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 SKP2-205ENST00000509692 1646 ntTSL 216.09■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.249e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.362e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 SKP2-202ENST00000274255 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.662e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 SKP2-207ENST00000513263 694 ntTSL 210.52□□□□□ -0.732e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 SKP2-206ENST00000513151 901 ntTSL 38.76□□□□□ -1.012e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.577e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.567e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.567e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.544e-17■■■■■ 42.4
RPS3P23396 MRPL3-209ENST00000511168 1377 ntTSL 216.83■□□□□ 0.287e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 MRPL3-210ENST00000512877 659 ntTSL 316.79■□□□□ 0.287e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.114e-17■■■■■ 42.4
RPS3P23396 ANXA6-210ENST00000520378 1119 ntTSL 514.06□□□□□ -0.166e-7■■■■■ 42.4
RPS3P23396 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.227e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 MRPL3-205ENST00000507669 848 ntTSL 313.39□□□□□ -0.277e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 MRPL3-208ENST00000510923 813 ntTSL 213.39□□□□□ -0.277e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.377e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 ANXA6-206ENST00000517757 553 ntTSL 412.59□□□□□ -0.396e-7■■■■■ 42.4
RPS3P23396 IMMT-209ENST00000474969 1431 ntTSL 512.55□□□□□ -0.47e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 IMMT-203ENST00000409258 1408 ntTSL 1 (best)12.55□□□□□ -0.47e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 FEN1-202ENST00000535307 768 ntTSL 212.24□□□□□ -0.457e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 IMMT-210ENST00000486633 631 ntTSL 212.12□□□□□ -0.477e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 IMMT-207ENST00000449247 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.547e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 IMMT-202ENST00000409051 2515 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.587e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 IMMT-206ENST00000442664 2627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.727e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 MRPL54-202ENST00000589174 491 ntTSL 310.48□□□□□ -0.737e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 PCK1-202ENST00000467047 5074 ntTSL 1 (best)10.3□□□□□ -0.767e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 PCK1-201ENST00000319441 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.787e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 MRPL3-207ENST00000510154 532 ntTSL 49.38□□□□□ -0.917e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.067e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 SERBP1-205ENST00000462814 624 ntTSL 23.71□□□□□ -1.827e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.223e-10■■■■■ 42.4
RPS3P23396 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.223e-10■■■■■ 42.4
RPS3P23396 MYL12A-205ENST00000578562 623 ntTSL 30.41□□□□□ -2.341e-10■■■■■ 42.4
RPS3P23396 MRPL3-204ENST00000506946 384 ntTSL 30.17□□□□□ -2.387e-8■■■■■ 42.4
RPS3P23396 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.142e-9■■■■■ 42.4
RPS3P23396 TMBIM6-218ENST00000549445 759 ntTSL 311.31□□□□□ -0.61e-8■■■■■ 42.3
RPS3P23396 TMBIM6-208ENST00000547187 669 ntTSL 511.2□□□□□ -0.621e-8■■■■■ 42.3
RPS3P23396 TMBIM6-216ENST00000549130 446 ntTSL 57.78□□□□□ -1.161e-8■■■■■ 42.3
RPS3P23396 TMBIM6-206ENST00000546914 521 ntTSL 46.49□□□□□ -1.371e-8■■■■■ 42.3
RPS3P23396 PEF1-202ENST00000461006 732 ntTSL 511.69□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 42.2
RPS3P23396 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.324e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.174e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.954e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.774e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.754e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.684e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.664e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.644e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 ACOT8-204ENST00000461272 1197 ntTSL 519.02■□□□□ 0.644e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.624e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 ACOT8-211ENST00000488679 1013 ntTSL 518.78■□□□□ 0.64e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 PCOLCE-207ENST00000486440 765 ntTSL 318.28■□□□□ 0.524e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 ACOT8-205ENST00000481938 552 ntTSL 317.58■□□□□ 0.44e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.264e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 ANGPTL4-205ENST00000594875 531 ntTSL 216.5■□□□□ 0.238e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 ACOT8-207ENST00000484783 1268 ntTSL 215.67■□□□□ 0.14e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.024e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 NDST1-203ENST00000518346 496 ntTSL 314.86□□□□□ -0.034e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 ACOT8-209ENST00000486165 764 ntTSL 314.41□□□□□ -0.14e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 ACOT8-202ENST00000426915 814 ntTSL 314.41□□□□□ -0.14e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.09□□□□□ -0.314e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.444e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 IGFBP3-206ENST00000448817 571 ntTSL 411.77□□□□□ -0.534e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 SMIM15-201ENST00000339020 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.564e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 ACOT8-212ENST00000493118 2808 ntTSL 211.55□□□□□ -0.564e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 ACOT8-206ENST00000483141 1187 ntTSL 210.29□□□□□ -0.764e-8■■■■■ 42.2
RPS3P23396 NOC2L-205ENST00000487214 865 ntTSL 318.57■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 42.2
RPS3P23396 PSMB6-204ENST00000575643 666 ntTSL 212.71□□□□□ -0.371e-9■■■■■ 42.1
RPS3P23396 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.544e-15■■■■■ 42
RPS3P23396 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.467e-7■■■■■ 41.8
RPS3P23396 UQCRC1-208ENST00000472438 477 ntTSL 213.91□□□□□ -0.189e-11■■■■■ 41.8
RPS3P23396 MAGT1-202ENST00000373336 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.84e-21■■■■■ 41.8
RPS3P23396 MAGT1-203ENST00000476168 959 ntTSL 29.04□□□□□ -0.964e-21■■■■■ 41.8
RPS3P23396 MAGT1-205ENST00000618282 2788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.134e-21■■■■■ 41.8
RPS3P23396 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.284e-21■■■■■ 41.8
RPS3P23396 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.314e-21■■■■■ 41.8
RPS3P23396 TRAPPC4-213ENST00000533149 1340 ntTSL 210.85□□□□□ -0.672e-8■■■■■ 41.7
RPS3P23396 TRAPPC4-204ENST00000524797 1924 ntTSL 210.82□□□□□ -0.682e-8■■■■■ 41.7
RPS3P23396 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.818e-8■■■■■ 41.7
RPS3P23396 CDC123-206ENST00000455773 959 ntTSL 517.18■□□□□ 0.348e-8■■■■■ 41.7
RPS3P23396 PLRG1-201ENST00000302078 1673 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 41.7
RPS3P23396 PLRG1-206ENST00000506192 855 ntTSL 27.82□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 41.7
RPS3P23396 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.42e-6■■■■■ 41.7
RPS3P23396 PLRG1-205ENST00000504341 723 ntTSL 35.86□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 41.7
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