Protein–RNA interactions for Protein: P23083

IGHV1-2, Immunoglobulin heavy variable 1-2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-2P23083 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGHV1-2P23083 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGHV1-2P23083 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGHV1-2P23083 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
IGHV1-2P23083 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IGHV1-2P23083 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGHV1-2P23083 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms