Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCP2P22307 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCP2P22307 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCP2P22307 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SCP2P22307 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCP2P22307 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SCP2P22307 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCP2P22307 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCP2P22307 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCP2P22307 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCP2P22307 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCP2P22307 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCP2P22307 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCP2P22307 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCP2P22307 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCP2P22307 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCP2P22307 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCP2P22307 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SCP2P22307 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCP2P22307 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCP2P22307 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCP2P22307 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCP2P22307 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SCP2P22307 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCP2P22307 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCP2P22307 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SCP2P22307 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCP2P22307 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCP2P22307 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCP2P22307 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SCP2P22307 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SCP2P22307 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCP2P22307 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCP2P22307 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCP2P22307 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCP2P22307 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SCP2P22307 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCP2P22307 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCP2P22307 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCP2P22307 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCP2P22307 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCP2P22307 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCP2P22307 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCP2P22307 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCP2P22307 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCP2P22307 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCP2P22307 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCP2P22307 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCP2P22307 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCP2P22307 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCP2P22307 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCP2P22307 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCP2P22307 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCP2P22307 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCP2P22307 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCP2P22307 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCP2P22307 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCP2P22307 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCP2P22307 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCP2P22307 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCP2P22307 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCP2P22307 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCP2P22307 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCP2P22307 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCP2P22307 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCP2P22307 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCP2P22307 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCP2P22307 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCP2P22307 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCP2P22307 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCP2P22307 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCP2P22307 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCP2P22307 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCP2P22307 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCP2P22307 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCP2P22307 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCP2P22307 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCP2P22307 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCP2P22307 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCP2P22307 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCP2P22307 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCP2P22307 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCP2P22307 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCP2P22307 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCP2P22307 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCP2P22307 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCP2P22307 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCP2P22307 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SCP2P22307 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SCP2P22307 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCP2P22307 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCP2P22307 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCP2P22307 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCP2P22307 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCP2P22307 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCP2P22307 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCP2P22307 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCP2P22307 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SCP2P22307 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCP2P22307 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms