Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN3P20807 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN3P20807 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN3P20807 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms