Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCN1P20061 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCN1P20061 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCN1P20061 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCN1P20061 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCN1P20061 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCN1P20061 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCN1P20061 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCN1P20061 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCN1P20061 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCN1P20061 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCN1P20061 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCN1P20061 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCN1P20061 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCN1P20061 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCN1P20061 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCN1P20061 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCN1P20061 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCN1P20061 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCN1P20061 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCN1P20061 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCN1P20061 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCN1P20061 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCN1P20061 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCN1P20061 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCN1P20061 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCN1P20061 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCN1P20061 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCN1P20061 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCN1P20061 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCN1P20061 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCN1P20061 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCN1P20061 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCN1P20061 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCN1P20061 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCN1P20061 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCN1P20061 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCN1P20061 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCN1P20061 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCN1P20061 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCN1P20061 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCN1P20061 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCN1P20061 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCN1P20061 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCN1P20061 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCN1P20061 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TCN1P20061 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TCN1P20061 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCN1P20061 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TCN1P20061 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCN1P20061 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCN1P20061 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCN1P20061 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCN1P20061 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCN1P20061 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCN1P20061 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCN1P20061 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCN1P20061 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCN1P20061 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCN1P20061 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCN1P20061 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCN1P20061 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCN1P20061 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCN1P20061 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCN1P20061 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCN1P20061 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCN1P20061 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCN1P20061 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCN1P20061 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCN1P20061 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCN1P20061 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCN1P20061 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCN1P20061 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCN1P20061 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCN1P20061 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCN1P20061 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCN1P20061 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCN1P20061 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCN1P20061 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCN1P20061 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCN1P20061 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCN1P20061 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCN1P20061 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCN1P20061 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCN1P20061 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCN1P20061 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCN1P20061 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCN1P20061 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCN1P20061 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCN1P20061 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TCN1P20061 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TCN1P20061 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCN1P20061 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCN1P20061 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCN1P20061 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCN1P20061 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCN1P20061 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCN1P20061 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCN1P20061 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCN1P20061 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms