Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DPA1P20036 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-DPA1P20036 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms