Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAG1P15918 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RAG1P15918 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RAG1P15918 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RAG1P15918 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAG1P15918 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RAG1P15918 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RAG1P15918 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAG1P15918 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAG1P15918 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RAG1P15918 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAG1P15918 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAG1P15918 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAG1P15918 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAG1P15918 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAG1P15918 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAG1P15918 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RAG1P15918 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAG1P15918 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAG1P15918 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAG1P15918 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAG1P15918 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RAG1P15918 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAG1P15918 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAG1P15918 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAG1P15918 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAG1P15918 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAG1P15918 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAG1P15918 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAG1P15918 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAG1P15918 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAG1P15918 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAG1P15918 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAG1P15918 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAG1P15918 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAG1P15918 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAG1P15918 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAG1P15918 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAG1P15918 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAG1P15918 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAG1P15918 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAG1P15918 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAG1P15918 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAG1P15918 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAG1P15918 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAG1P15918 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RAG1P15918 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAG1P15918 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAG1P15918 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAG1P15918 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAG1P15918 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAG1P15918 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAG1P15918 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAG1P15918 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RAG1P15918 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RAG1P15918 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAG1P15918 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAG1P15918 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAG1P15918 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAG1P15918 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAG1P15918 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RAG1P15918 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAG1P15918 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAG1P15918 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RAG1P15918 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAG1P15918 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAG1P15918 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAG1P15918 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAG1P15918 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAG1P15918 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAG1P15918 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAG1P15918 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAG1P15918 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAG1P15918 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAG1P15918 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RAG1P15918 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RAG1P15918 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAG1P15918 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAG1P15918 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAG1P15918 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAG1P15918 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAG1P15918 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RAG1P15918 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAG1P15918 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAG1P15918 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAG1P15918 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAG1P15918 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAG1P15918 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAG1P15918 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAG1P15918 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAG1P15918 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAG1P15918 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAG1P15918 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAG1P15918 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAG1P15918 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAG1P15918 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAG1P15918 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAG1P15918 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAG1P15918 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAG1P15918 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.5 ms