Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CKBP12277 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CKBP12277 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CKBP12277 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKBP12277 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKBP12277 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKBP12277 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKBP12277 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CKBP12277 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CKBP12277 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CKBP12277 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CKBP12277 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CKBP12277 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CKBP12277 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CKBP12277 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CKBP12277 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CKBP12277 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CKBP12277 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CKBP12277 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CKBP12277 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CKBP12277 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CKBP12277 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CKBP12277 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CKBP12277 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CKBP12277 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CKBP12277 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CKBP12277 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CKBP12277 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CKBP12277 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CKBP12277 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CKBP12277 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CKBP12277 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CKBP12277 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CKBP12277 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CKBP12277 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CKBP12277 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CKBP12277 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CKBP12277 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CKBP12277 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKBP12277 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKBP12277 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKBP12277 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKBP12277 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKBP12277 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKBP12277 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKBP12277 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKBP12277 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKBP12277 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CKBP12277 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CKBP12277 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CKBP12277 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CKBP12277 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CKBP12277 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CKBP12277 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CKBP12277 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CKBP12277 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CKBP12277 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CKBP12277 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CKBP12277 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CKBP12277 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CKBP12277 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CKBP12277 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CKBP12277 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CKBP12277 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CKBP12277 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CKBP12277 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CKBP12277 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CKBP12277 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKBP12277 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKBP12277 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKBP12277 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKBP12277 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKBP12277 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CKBP12277 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CKBP12277 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CKBP12277 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CKBP12277 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CKBP12277 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CKBP12277 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CKBP12277 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CKBP12277 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CKBP12277 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CKBP12277 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CKBP12277 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CKBP12277 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CKBP12277 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CKBP12277 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CKBP12277 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CKBP12277 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CKBP12277 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CKBP12277 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CKBP12277 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CKBP12277 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CKBP12277 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CKBP12277 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CKBP12277 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CKBP12277 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CKBP12277 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CKBP12277 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CKBP12277 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms