Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL3P10147 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL3P10147 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL3P10147 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL3P10147 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL3P10147 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL3P10147 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL3P10147 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL3P10147 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL3P10147 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL3P10147 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL3P10147 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL3P10147 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL3P10147 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL3P10147 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL3P10147 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL3P10147 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL3P10147 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL3P10147 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL3P10147 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL3P10147 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL3P10147 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL3P10147 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL3P10147 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL3P10147 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL3P10147 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL3P10147 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL3P10147 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL3P10147 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL3P10147 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL3P10147 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL3P10147 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL3P10147 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL3P10147 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL3P10147 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL3P10147 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL3P10147 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL3P10147 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL3P10147 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL3P10147 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL3P10147 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL3P10147 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL3P10147 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL3P10147 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL3P10147 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL3P10147 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL3P10147 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL3P10147 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL3P10147 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL3P10147 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL3P10147 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL3P10147 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL3P10147 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL3P10147 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL3P10147 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL3P10147 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL3P10147 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL3P10147 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL3P10147 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL3P10147 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL3P10147 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL3P10147 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL3P10147 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL3P10147 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL3P10147 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL3P10147 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL3P10147 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL3P10147 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL3P10147 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL3P10147 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL3P10147 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL3P10147 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL3P10147 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL3P10147 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL3P10147 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL3P10147 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL3P10147 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL3P10147 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL3P10147 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL3P10147 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL3P10147 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL3P10147 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL3P10147 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL3P10147 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL3P10147 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL3P10147 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL3P10147 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL3P10147 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL3P10147 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL3P10147 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL3P10147 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL3P10147 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL3P10147 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL3P10147 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL3P10147 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL3P10147 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL3P10147 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL3P10147 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL3P10147 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL3P10147 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms