Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
RGPD2P0DJD1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
RGPD2P0DJD1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD2P0DJD1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD2P0DJD1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD2P0DJD1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD2P0DJD1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD2P0DJD1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD2P0DJD1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD2P0DJD1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RGPD2P0DJD1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RGPD2P0DJD1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RGPD2P0DJD1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RGPD2P0DJD1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RGPD2P0DJD1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RGPD2P0DJD1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
RGPD2P0DJD1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RGPD2P0DJD1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
RGPD2P0DJD1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
RGPD2P0DJD1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RGPD2P0DJD1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms