Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYL1P05976 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.58■■■□□ 2
MYL1P05976 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MYL1P05976 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYL1P05976 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MYL1P05976 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYL1P05976 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MYL1P05976 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYL1P05976 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MYL1P05976 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYL1P05976 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MYL1P05976 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MYL1P05976 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MYL1P05976 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MYL1P05976 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MYL1P05976 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYL1P05976 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYL1P05976 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYL1P05976 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
MYL1P05976 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYL1P05976 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYL1P05976 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MYL1P05976 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MYL1P05976 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYL1P05976 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYL1P05976 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYL1P05976 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYL1P05976 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MYL1P05976 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
MYL1P05976 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYL1P05976 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYL1P05976 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYL1P05976 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYL1P05976 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYL1P05976 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MYL1P05976 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYL1P05976 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYL1P05976 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYL1P05976 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MYL1P05976 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYL1P05976 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYL1P05976 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYL1P05976 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYL1P05976 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYL1P05976 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYL1P05976 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYL1P05976 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYL1P05976 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYL1P05976 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYL1P05976 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYL1P05976 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYL1P05976 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYL1P05976 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYL1P05976 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYL1P05976 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYL1P05976 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYL1P05976 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYL1P05976 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYL1P05976 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYL1P05976 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYL1P05976 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MYL1P05976 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYL1P05976 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYL1P05976 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYL1P05976 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYL1P05976 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYL1P05976 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MYL1P05976 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MYL1P05976 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
MYL1P05976 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYL1P05976 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYL1P05976 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYL1P05976 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYL1P05976 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYL1P05976 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYL1P05976 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYL1P05976 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MYL1P05976 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYL1P05976 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MYL1P05976 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MYL1P05976 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYL1P05976 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYL1P05976 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYL1P05976 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYL1P05976 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYL1P05976 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MYL1P05976 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYL1P05976 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYL1P05976 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYL1P05976 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYL1P05976 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYL1P05976 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYL1P05976 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYL1P05976 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYL1P05976 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYL1P05976 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYL1P05976 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYL1P05976 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MYL1P05976 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MYL1P05976 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms