Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MYCNP04198 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYCNP04198 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYCNP04198 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYCNP04198 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYCNP04198 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYCNP04198 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYCNP04198 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MYCNP04198 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYCNP04198 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYCNP04198 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYCNP04198 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYCNP04198 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYCNP04198 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYCNP04198 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYCNP04198 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MYCNP04198 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYCNP04198 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYCNP04198 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYCNP04198 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYCNP04198 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYCNP04198 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MYCNP04198 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYCNP04198 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYCNP04198 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYCNP04198 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYCNP04198 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MYCNP04198 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MYCNP04198 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MYCNP04198 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MYCNP04198 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MYCNP04198 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYCNP04198 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYCNP04198 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYCNP04198 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYCNP04198 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYCNP04198 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYCNP04198 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MYCNP04198 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYCNP04198 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYCNP04198 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYCNP04198 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYCNP04198 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MYCNP04198 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYCNP04198 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYCNP04198 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYCNP04198 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYCNP04198 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYCNP04198 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYCNP04198 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYCNP04198 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MYCNP04198 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYCNP04198 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MYCNP04198 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MYCNP04198 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MYCNP04198 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MYCNP04198 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MYCNP04198 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYCNP04198 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYCNP04198 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYCNP04198 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MYCNP04198 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYCNP04198 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYCNP04198 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYCNP04198 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYCNP04198 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYCNP04198 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MYCNP04198 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYCNP04198 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MYCNP04198 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYCNP04198 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYCNP04198 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYCNP04198 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYCNP04198 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MYCNP04198 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYCNP04198 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MYCNP04198 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYCNP04198 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYCNP04198 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYCNP04198 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYCNP04198 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYCNP04198 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYCNP04198 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYCNP04198 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MYCNP04198 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYCNP04198 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYCNP04198 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYCNP04198 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYCNP04198 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYCNP04198 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYCNP04198 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYCNP04198 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYCNP04198 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYCNP04198 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYCNP04198 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYCNP04198 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYCNP04198 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYCNP04198 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYCNP04198 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYCNP04198 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms