Protein–RNA interactions for Protein: P02778

CXCL10, C-X-C motif chemokine 10, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL10P02778 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CXCL10P02778 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CXCL10P02778 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CXCL10P02778 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms