Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CD4P01730 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CD4P01730 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CD4P01730 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CD4P01730 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CD4P01730 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CD4P01730 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CD4P01730 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CD4P01730 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CD4P01730 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CD4P01730 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CD4P01730 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CD4P01730 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CD4P01730 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CD4P01730 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CD4P01730 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CD4P01730 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CD4P01730 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CD4P01730 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CD4P01730 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CD4P01730 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CD4P01730 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CD4P01730 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CD4P01730 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CD4P01730 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CD4P01730 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CD4P01730 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CD4P01730 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CD4P01730 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CD4P01730 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CD4P01730 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CD4P01730 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CD4P01730 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CD4P01730 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CD4P01730 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CD4P01730 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CD4P01730 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CD4P01730 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CD4P01730 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CD4P01730 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CD4P01730 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CD4P01730 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CD4P01730 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CD4P01730 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CD4P01730 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CD4P01730 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CD4P01730 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CD4P01730 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CD4P01730 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CD4P01730 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CD4P01730 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CD4P01730 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CD4P01730 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CD4P01730 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CD4P01730 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CD4P01730 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CD4P01730 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CD4P01730 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CD4P01730 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CD4P01730 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CD4P01730 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CD4P01730 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CD4P01730 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CD4P01730 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CD4P01730 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CD4P01730 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CD4P01730 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CD4P01730 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CD4P01730 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CD4P01730 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CD4P01730 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CD4P01730 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CD4P01730 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CD4P01730 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD4P01730 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CD4P01730 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD4P01730 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD4P01730 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD4P01730 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD4P01730 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD4P01730 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD4P01730 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD4P01730 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD4P01730 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD4P01730 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD4P01730 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD4P01730 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD4P01730 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD4P01730 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD4P01730 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD4P01730 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD4P01730 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD4P01730 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD4P01730 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD4P01730 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CD4P01730 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CD4P01730 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD4P01730 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD4P01730 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD4P01730 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms