Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SVILO95425 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SVILO95425 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SVILO95425 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SVILO95425 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SVILO95425 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SVILO95425 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SVILO95425 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SVILO95425 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SVILO95425 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SVILO95425 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SVILO95425 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SVILO95425 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SVILO95425 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SVILO95425 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SVILO95425 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SVILO95425 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SVILO95425 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SVILO95425 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SVILO95425 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SVILO95425 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SVILO95425 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SVILO95425 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SVILO95425 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SVILO95425 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SVILO95425 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SVILO95425 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SVILO95425 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SVILO95425 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SVILO95425 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SVILO95425 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SVILO95425 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SVILO95425 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SVILO95425 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SVILO95425 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SVILO95425 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SVILO95425 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SVILO95425 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SVILO95425 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SVILO95425 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SVILO95425 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SVILO95425 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SVILO95425 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SVILO95425 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SVILO95425 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SVILO95425 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SVILO95425 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SVILO95425 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SVILO95425 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SVILO95425 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SVILO95425 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SVILO95425 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SVILO95425 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SVILO95425 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SVILO95425 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SVILO95425 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SVILO95425 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SVILO95425 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SVILO95425 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SVILO95425 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SVILO95425 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SVILO95425 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SVILO95425 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SVILO95425 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SVILO95425 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SVILO95425 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SVILO95425 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SVILO95425 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SVILO95425 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SVILO95425 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SVILO95425 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SVILO95425 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SVILO95425 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SVILO95425 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SVILO95425 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SVILO95425 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SVILO95425 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SVILO95425 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SVILO95425 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SVILO95425 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SVILO95425 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SVILO95425 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SVILO95425 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SVILO95425 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SVILO95425 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SVILO95425 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SVILO95425 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SVILO95425 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SVILO95425 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SVILO95425 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SVILO95425 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SVILO95425 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SVILO95425 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SVILO95425 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SVILO95425 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SVILO95425 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SVILO95425 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SVILO95425 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SVILO95425 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SVILO95425 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms