Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ECM2O94769 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ECM2O94769 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ECM2O94769 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ECM2O94769 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ECM2O94769 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ECM2O94769 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ECM2O94769 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ECM2O94769 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ECM2O94769 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ECM2O94769 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ECM2O94769 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ECM2O94769 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ECM2O94769 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ECM2O94769 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ECM2O94769 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ECM2O94769 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ECM2O94769 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ECM2O94769 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ECM2O94769 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ECM2O94769 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ECM2O94769 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ECM2O94769 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ECM2O94769 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ECM2O94769 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ECM2O94769 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ECM2O94769 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ECM2O94769 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ECM2O94769 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ECM2O94769 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ECM2O94769 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ECM2O94769 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ECM2O94769 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ECM2O94769 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ECM2O94769 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ECM2O94769 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ECM2O94769 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ECM2O94769 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ECM2O94769 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ECM2O94769 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ECM2O94769 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ECM2O94769 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ECM2O94769 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ECM2O94769 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ECM2O94769 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ECM2O94769 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ECM2O94769 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ECM2O94769 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ECM2O94769 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ECM2O94769 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ECM2O94769 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ECM2O94769 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ECM2O94769 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ECM2O94769 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ECM2O94769 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ECM2O94769 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ECM2O94769 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ECM2O94769 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ECM2O94769 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ECM2O94769 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ECM2O94769 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ECM2O94769 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ECM2O94769 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ECM2O94769 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ECM2O94769 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ECM2O94769 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ECM2O94769 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ECM2O94769 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ECM2O94769 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ECM2O94769 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ECM2O94769 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ECM2O94769 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ECM2O94769 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ECM2O94769 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ECM2O94769 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ECM2O94769 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ECM2O94769 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ECM2O94769 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ECM2O94769 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ECM2O94769 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ECM2O94769 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ECM2O94769 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ECM2O94769 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ECM2O94769 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ECM2O94769 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ECM2O94769 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ECM2O94769 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ECM2O94769 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ECM2O94769 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ECM2O94769 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ECM2O94769 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ECM2O94769 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ECM2O94769 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ECM2O94769 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ECM2O94769 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ECM2O94769 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ECM2O94769 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ECM2O94769 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ECM2O94769 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ECM2O94769 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms