Protein–RNA interactions for Protein: O75973

C1QL1, C1q-related factor, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL1O75973 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QL1O75973 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QL1O75973 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QL1O75973 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QL1O75973 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QL1O75973 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1QL1O75973 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1QL1O75973 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QL1O75973 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms