Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BANF1O75531 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BANF1O75531 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BANF1O75531 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BANF1O75531 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BANF1O75531 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BANF1O75531 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BANF1O75531 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BANF1O75531 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BANF1O75531 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BANF1O75531 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BANF1O75531 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BANF1O75531 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BANF1O75531 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BANF1O75531 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BANF1O75531 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BANF1O75531 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BANF1O75531 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BANF1O75531 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BANF1O75531 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BANF1O75531 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BANF1O75531 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BANF1O75531 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BANF1O75531 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BANF1O75531 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BANF1O75531 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BANF1O75531 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BANF1O75531 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BANF1O75531 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BANF1O75531 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BANF1O75531 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BANF1O75531 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BANF1O75531 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BANF1O75531 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BANF1O75531 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BANF1O75531 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BANF1O75531 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BANF1O75531 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BANF1O75531 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BANF1O75531 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BANF1O75531 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BANF1O75531 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BANF1O75531 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BANF1O75531 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BANF1O75531 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BANF1O75531 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BANF1O75531 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BANF1O75531 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BANF1O75531 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BANF1O75531 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BANF1O75531 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BANF1O75531 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BANF1O75531 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BANF1O75531 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BANF1O75531 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BANF1O75531 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BANF1O75531 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BANF1O75531 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BANF1O75531 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BANF1O75531 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BANF1O75531 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BANF1O75531 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BANF1O75531 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BANF1O75531 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BANF1O75531 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BANF1O75531 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BANF1O75531 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BANF1O75531 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BANF1O75531 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BANF1O75531 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BANF1O75531 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BANF1O75531 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BANF1O75531 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BANF1O75531 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BANF1O75531 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BANF1O75531 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BANF1O75531 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BANF1O75531 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BANF1O75531 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BANF1O75531 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BANF1O75531 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BANF1O75531 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BANF1O75531 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BANF1O75531 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BANF1O75531 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BANF1O75531 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BANF1O75531 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BANF1O75531 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BANF1O75531 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BANF1O75531 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BANF1O75531 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BANF1O75531 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BANF1O75531 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BANF1O75531 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BANF1O75531 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BANF1O75531 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BANF1O75531 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BANF1O75531 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BANF1O75531 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BANF1O75531 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms