Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRPF40AO75400 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRPF40AO75400 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRPF40AO75400 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRPF40AO75400 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRPF40AO75400 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PRPF40AO75400 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PRPF40AO75400 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF40AO75400 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF40AO75400 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF40AO75400 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF40AO75400 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF40AO75400 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF40AO75400 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF40AO75400 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF40AO75400 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF40AO75400 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF40AO75400 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF40AO75400 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF40AO75400 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF40AO75400 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF40AO75400 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPF40AO75400 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PRPF40AO75400 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRPF40AO75400 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRPF40AO75400 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRPF40AO75400 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRPF40AO75400 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF40AO75400 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF40AO75400 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF40AO75400 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRPF40AO75400 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PRPF40AO75400 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRPF40AO75400 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF40AO75400 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF40AO75400 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF40AO75400 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF40AO75400 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF40AO75400 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF40AO75400 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF40AO75400 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF40AO75400 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF40AO75400 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF40AO75400 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF40AO75400 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRPF40AO75400 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRPF40AO75400 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPF40AO75400 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPF40AO75400 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF40AO75400 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF40AO75400 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF40AO75400 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF40AO75400 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF40AO75400 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF40AO75400 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF40AO75400 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF40AO75400 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF40AO75400 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF40AO75400 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF40AO75400 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF40AO75400 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF40AO75400 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF40AO75400 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF40AO75400 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF40AO75400 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPF40AO75400 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPF40AO75400 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms