Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.69■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 825.7 ms