Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRICKLE3O43900 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRICKLE3O43900 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRICKLE3O43900 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms