Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC28A2O43868 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC28A2O43868 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms