Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRNO43815 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRNO43815 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRNO43815 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRNO43815 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRNO43815 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
STRNO43815 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
STRNO43815 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRNO43815 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRNO43815 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRNO43815 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
STRNO43815 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRNO43815 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRNO43815 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRNO43815 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRNO43815 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRNO43815 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRNO43815 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
STRNO43815 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRNO43815 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRNO43815 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRNO43815 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRNO43815 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRNO43815 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRNO43815 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRNO43815 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRNO43815 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
STRNO43815 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRNO43815 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRNO43815 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRNO43815 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRNO43815 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRNO43815 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
STRNO43815 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRNO43815 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRNO43815 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRNO43815 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRNO43815 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRNO43815 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRNO43815 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRNO43815 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRNO43815 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRNO43815 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRNO43815 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRNO43815 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRNO43815 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRNO43815 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRNO43815 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRNO43815 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRNO43815 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRNO43815 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRNO43815 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRNO43815 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRNO43815 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRNO43815 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRNO43815 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRNO43815 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRNO43815 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRNO43815 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRNO43815 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRNO43815 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRNO43815 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRNO43815 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRNO43815 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
STRNO43815 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRNO43815 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRNO43815 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRNO43815 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRNO43815 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRNO43815 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRNO43815 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
STRNO43815 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
STRNO43815 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRNO43815 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRNO43815 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRNO43815 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRNO43815 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRNO43815 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRNO43815 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRNO43815 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRNO43815 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRNO43815 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRNO43815 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
STRNO43815 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRNO43815 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRNO43815 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRNO43815 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRNO43815 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
STRNO43815 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRNO43815 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRNO43815 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRNO43815 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRNO43815 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
STRNO43815 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRNO43815 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STRNO43815 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STRNO43815 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
STRNO43815 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
STRNO43815 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STRNO43815 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms