Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LANCL1O43813 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LANCL1O43813 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LANCL1O43813 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LANCL1O43813 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LANCL1O43813 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LANCL1O43813 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LANCL1O43813 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LANCL1O43813 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LANCL1O43813 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LANCL1O43813 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LANCL1O43813 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LANCL1O43813 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LANCL1O43813 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LANCL1O43813 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LANCL1O43813 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LANCL1O43813 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LANCL1O43813 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LANCL1O43813 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LANCL1O43813 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LANCL1O43813 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LANCL1O43813 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LANCL1O43813 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LANCL1O43813 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LANCL1O43813 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LANCL1O43813 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LANCL1O43813 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LANCL1O43813 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LANCL1O43813 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LANCL1O43813 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LANCL1O43813 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LANCL1O43813 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LANCL1O43813 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LANCL1O43813 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LANCL1O43813 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LANCL1O43813 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms