Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKAB2O43741 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PRKAB2O43741 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRKAB2O43741 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRKAB2O43741 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRKAB2O43741 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRKAB2O43741 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRKAB2O43741 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRKAB2O43741 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRKAB2O43741 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRKAB2O43741 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRKAB2O43741 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PRKAB2O43741 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRKAB2O43741 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PRKAB2O43741 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRKAB2O43741 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRKAB2O43741 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PRKAB2O43741 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRKAB2O43741 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRKAB2O43741 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRKAB2O43741 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRKAB2O43741 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKAB2O43741 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms