Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CRXO43186 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CRXO43186 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CRXO43186 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CRXO43186 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CRXO43186 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CRXO43186 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CRXO43186 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CRXO43186 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CRXO43186 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CRXO43186 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CRXO43186 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CRXO43186 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CRXO43186 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CRXO43186 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CRXO43186 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CRXO43186 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CRXO43186 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CRXO43186 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CRXO43186 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CRXO43186 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CRXO43186 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CRXO43186 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRXO43186 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRXO43186 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRXO43186 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRXO43186 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRXO43186 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRXO43186 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRXO43186 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRXO43186 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CRXO43186 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRXO43186 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRXO43186 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRXO43186 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRXO43186 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRXO43186 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRXO43186 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRXO43186 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRXO43186 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRXO43186 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRXO43186 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRXO43186 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRXO43186 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRXO43186 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRXO43186 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRXO43186 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRXO43186 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRXO43186 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRXO43186 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRXO43186 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRXO43186 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRXO43186 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRXO43186 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRXO43186 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRXO43186 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRXO43186 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRXO43186 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRXO43186 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRXO43186 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRXO43186 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRXO43186 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRXO43186 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRXO43186 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRXO43186 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRXO43186 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRXO43186 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRXO43186 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRXO43186 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRXO43186 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRXO43186 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRXO43186 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRXO43186 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRXO43186 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRXO43186 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRXO43186 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CRXO43186 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRXO43186 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRXO43186 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRXO43186 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRXO43186 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CRXO43186 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRXO43186 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRXO43186 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRXO43186 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRXO43186 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRXO43186 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRXO43186 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRXO43186 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRXO43186 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRXO43186 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRXO43186 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRXO43186 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRXO43186 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRXO43186 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRXO43186 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRXO43186 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRXO43186 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRXO43186 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRXO43186 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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