Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLOCKO15516 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLOCKO15516 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLOCKO15516 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms