Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARPC1BO15143 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ARPC1BO15143 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARPC1BO15143 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARPC1BO15143 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ARPC1BO15143 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARPC1BO15143 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARPC1BO15143 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARPC1BO15143 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms