Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28O15084 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ANKRD28O15084 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms