Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SYNMO15061 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
SYNMO15061 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SYNMO15061 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SYNMO15061 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYNMO15061 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYNMO15061 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYNMO15061 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYNMO15061 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYNMO15061 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
SYNMO15061 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SYNMO15061 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SYNMO15061 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SYNMO15061 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SYNMO15061 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SYNMO15061 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SYNMO15061 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SYNMO15061 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SYNMO15061 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
SYNMO15061 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SYNMO15061 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SYNMO15061 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SYNMO15061 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SYNMO15061 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SYNMO15061 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SYNMO15061 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SYNMO15061 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SYNMO15061 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
SYNMO15061 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
SYNMO15061 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SYNMO15061 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SYNMO15061 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
SYNMO15061 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SYNMO15061 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SYNMO15061 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SYNMO15061 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SYNMO15061 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SYNMO15061 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SYNMO15061 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYNMO15061 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYNMO15061 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYNMO15061 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYNMO15061 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SYNMO15061 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SYNMO15061 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SYNMO15061 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SYNMO15061 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SYNMO15061 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SYNMO15061 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SYNMO15061 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SYNMO15061 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SYNMO15061 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SYNMO15061 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SYNMO15061 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNMO15061 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNMO15061 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNMO15061 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNMO15061 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNMO15061 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNMO15061 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNMO15061 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNMO15061 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNMO15061 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNMO15061 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
SYNMO15061 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYNMO15061 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SYNMO15061 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
SYNMO15061 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SYNMO15061 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SYNMO15061 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
SYNMO15061 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SYNMO15061 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SYNMO15061 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SYNMO15061 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SYNMO15061 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SYNMO15061 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SYNMO15061 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SYNMO15061 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SYNMO15061 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
SYNMO15061 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SYNMO15061 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNMO15061 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNMO15061 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNMO15061 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNMO15061 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNMO15061 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYNMO15061 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYNMO15061 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SYNMO15061 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SYNMO15061 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SYNMO15061 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SYNMO15061 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SYNMO15061 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SYNMO15061 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SYNMO15061 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SYNMO15061 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SYNMO15061 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SYNMO15061 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SYNMO15061 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
SYNMO15061 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms