Protein–RNA interactions for Protein: C9J4A7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9J4A7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9J4A7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C9J4A7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9J4A7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9J4A7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9J4A7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9J4A7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9J4A7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9J4A7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9J4A7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C9J4A7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C9J4A7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9J4A7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9J4A7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9J4A7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9J4A7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9J4A7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C9J4A7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9J4A7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9J4A7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9J4A7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9J4A7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9J4A7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9J4A7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C9J4A7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9J4A7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9J4A7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9J4A7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9J4A7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9J4A7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9J4A7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9J4A7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9J4A7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9J4A7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9J4A7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C9J4A7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9J4A7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9J4A7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9J4A7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9J4A7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9J4A7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9J4A7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9J4A7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C9J4A7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9J4A7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9J4A7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9J4A7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C9J4A7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9J4A7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9J4A7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9J4A7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9J4A7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9J4A7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9J4A7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9J4A7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9J4A7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9J4A7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9J4A7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9J4A7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9J4A7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9J4A7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9J4A7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9J4A7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9J4A7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9J4A7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9J4A7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9J4A7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9J4A7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C9J4A7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C9J4A7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9J4A7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9J4A7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9J4A7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9J4A7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9J4A7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9J4A7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9J4A7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9J4A7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9J4A7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9J4A7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9J4A7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C9J4A7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9J4A7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9J4A7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9J4A7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9J4A7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9J4A7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9J4A7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9J4A7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9J4A7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9J4A7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9J4A7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C9J4A7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9J4A7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9J4A7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9J4A7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9J4A7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9J4A7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9J4A7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9J4A7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.9 ms