Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf172C9J069 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf172C9J069 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf172C9J069 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms