Protein–RNA interactions for Protein: B2RBV5

Putative MORF4 family-associated protein 1-like protein UPP, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2RBV5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
B2RBV5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
B2RBV5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
B2RBV5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
B2RBV5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
B2RBV5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
B2RBV5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
B2RBV5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
B2RBV5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
B2RBV5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
B2RBV5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
B2RBV5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
B2RBV5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
B2RBV5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
B2RBV5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
B2RBV5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
B2RBV5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
B2RBV5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
B2RBV5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
B2RBV5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
B2RBV5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
B2RBV5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
B2RBV5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
B2RBV5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
B2RBV5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
B2RBV5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
B2RBV5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
B2RBV5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
B2RBV5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
B2RBV5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
B2RBV5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
B2RBV5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
B2RBV5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
B2RBV5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
B2RBV5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
B2RBV5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
B2RBV5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
B2RBV5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
B2RBV5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
B2RBV5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
B2RBV5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
B2RBV5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
B2RBV5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
B2RBV5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
B2RBV5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
B2RBV5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
B2RBV5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
B2RBV5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
B2RBV5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
B2RBV5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
B2RBV5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
B2RBV5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
B2RBV5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
B2RBV5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
B2RBV5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
B2RBV5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
B2RBV5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
B2RBV5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
B2RBV5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
B2RBV5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
B2RBV5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
B2RBV5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
B2RBV5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
B2RBV5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
B2RBV5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
B2RBV5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
B2RBV5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
B2RBV5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
B2RBV5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
B2RBV5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
B2RBV5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
B2RBV5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
B2RBV5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
B2RBV5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
B2RBV5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
B2RBV5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
B2RBV5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
B2RBV5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
B2RBV5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
B2RBV5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
B2RBV5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
B2RBV5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
B2RBV5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
B2RBV5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
B2RBV5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
B2RBV5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
B2RBV5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
B2RBV5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
B2RBV5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
B2RBV5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
B2RBV5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
B2RBV5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
B2RBV5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
B2RBV5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
B2RBV5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
B2RBV5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
B2RBV5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
B2RBV5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
B2RBV5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
B2RBV5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms