Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms