Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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ITGA9Q13797 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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ITGA9Q13797 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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ITGA9Q13797 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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ITGA9Q13797 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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ITGA9Q13797 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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ITGA9Q13797 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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