Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 RHOH-203ENST00000503941 789 ntTSL 28.71□□□□□ -1.021e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 RHOH-209ENST00000511121 571 ntTSL 28.26□□□□□ -1.091e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 RHOH-210ENST00000511967 423 ntTSL 37.63□□□□□ -1.191e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 RHOH-215ENST00000515702 574 ntTSL 47.59□□□□□ -1.191e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 RHOH-216ENST00000515718 574 ntTSL 47.09□□□□□ -1.271e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 RHOH-204ENST00000503978 545 ntTSL 45.67□□□□□ -1.51e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 RHOH-214ENST00000515503 549 ntTSL 45.49□□□□□ -1.531e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 RHOH-213ENST00000514839 560 ntTSL 45.02□□□□□ -1.611e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.113e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 POLE3-204ENST00000479871 2396 ntTSL 213.54□□□□□ -0.243e-11■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 POLE3-202ENST00000374171 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.613e-11■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 POLE3-201ENST00000374169 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.723e-11■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 PPP4R3A-202ENST00000554390 2953 ntTSL 1 (best)16.35■□□□□ 0.213e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.23e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.063e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 PPP4R3A-201ENST00000554308 2515 ntTSL 513.64□□□□□ -0.233e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 PPP4R3A-206ENST00000554943 3369 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.523e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 CLASRP-215ENST00000592056 582 ntTSL 220.1■□□□□ 0.814e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.44e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.294e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 CLASRP-202ENST00000391952 2213 ntTSL 1 (best)14.78□□□□□ -0.044e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.076e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.24e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 CLASRP-207ENST00000587112 867 ntTSL 1 (best)12.54□□□□□ -0.44e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 CLASRP-212ENST00000588936 590 ntTSL 411.9□□□□□ -0.54e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 DIP2A-206ENST00000472364 2542 ntTSL 211.46□□□□□ -0.572e-8■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 CLASRP-213ENST00000591410 572 ntTSL 411.28□□□□□ -0.64e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 DIP2A-211ENST00000481883 3119 ntTSL 1 (best)11.1□□□□□ -0.632e-8■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 ZNF736-201ENST00000355095 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.892e-8■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 ZNF736-202ENST00000423484 7119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.052e-8■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.194e-8■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 VRK1-206ENST00000557222 1029 ntTSL 58.91□□□□□ -0.984e-8■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 VRK1-203ENST00000555067 604 ntTSL 36.66□□□□□ -1.344e-8■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 FLNA-216ENST00000490936 5374 ntTSL 1 (best)15.58■□□□□ 0.082e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.172e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.332e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 FLNA-206ENST00000420627 8225 ntTSL 512.83□□□□□ -0.362e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.442e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.542e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.552e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.12e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.442e-6■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.714e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.594e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.34e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.144e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.114e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.174e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 YTHDF3-208ENST00000615676 5092 ntTSL 1 (best)13.38□□□□□ -0.274e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.294e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.324e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 LARP1B-210ENST00000512292 3105 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.927e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 LARP1B-207ENST00000507377 1593 ntTSL 28.99□□□□□ -0.977e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 LARP1B-202ENST00000394288 2151 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.067e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.247e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 LARP1B-209ENST00000508819 1891 ntTSL 56.92□□□□□ -1.37e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.347e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 AL110292.1-202ENST00000552303 568 ntTSL 4 BASIC8.12□□□□□ -1.111e-9■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.219e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.159e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.159e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.099e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.169e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.729e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.151e-6■■■□□ 15
TARDBPQ13148 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.411e-7■■■□□ 15
TARDBPQ13148 GLYR1-206ENST00000587875 630 ntTSL 216.99■□□□□ 0.311e-7■■■□□ 15
TARDBPQ13148 GLYR1-208ENST00000588297 580 ntTSL 316.7■□□□□ 0.261e-7■■■□□ 15
TARDBPQ13148 EXOSC3-203ENST00000465229 1625 ntTSL 216.07■□□□□ 0.161e-7■■■□□ 15
TARDBPQ13148 KCTD10-205ENST00000537165 2940 ntTSL 214.29□□□□□ -0.121e-7■■■□□ 15
TARDBPQ13148 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.431e-7■■■□□ 15
TARDBPQ13148 GLYR1-201ENST00000321919 3772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.541e-7■■■□□ 15
TARDBPQ13148 GLYR1-202ENST00000436648 3466 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.631e-7■■■□□ 15
TARDBPQ13148 GLYR1-211ENST00000591159 557 ntTSL 510.91□□□□□ -0.661e-7■■■□□ 15
TARDBPQ13148 GLYR1-210ENST00000589389 3606 ntTSL 1 (best)10.74□□□□□ -0.691e-7■■■□□ 15
TARDBPQ13148 GLYR1-209ENST00000588732 3527 ntTSL 1 (best)9.51□□□□□ -0.891e-7■■■□□ 15
TARDBPQ13148 VTI1A-202ENST00000432306 1738 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.171e-7■■■□□ 15
TARDBPQ13148 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.191e-7■■■□□ 15
TARDBPQ13148 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.251e-6■■■□□ 15
TARDBPQ13148 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.21e-6■■■□□ 15
TARDBPQ13148 RABL6-210ENST00000484471 2746 ntTSL 519.03■□□□□ 0.641e-6■■■□□ 15
TARDBPQ13148 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.331e-6■■■□□ 15
TARDBPQ13148 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.231e-6■■■□□ 15
TARDBPQ13148 RABL6-208ENST00000464941 3361 ntTSL 216.04■□□□□ 0.161e-6■■■□□ 15
TARDBPQ13148 RABL6-206ENST00000436380 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.38□□□□□ -0.111e-6■■■□□ 15
TARDBPQ13148 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.161e-6■■■□□ 15
TARDBPQ13148 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.411e-6■■■□□ 15
TARDBPQ13148 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.681e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.31e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.54e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 CPQ-202ENST00000517742 660 ntTSL 56.49□□□□□ -1.374e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 CPQ-204ENST00000519900 566 ntTSL 46.44□□□□□ -1.384e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 CRKL-202ENST00000411769 2037 ntTSL 1 (best)17.69■□□□□ 0.425e-7■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.395e-7■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 PAPD4-207ENST00000504233 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.77e-12■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 PAPD4-201ENST00000296783 3129 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.837e-12■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 RACGAP1-209ENST00000547905 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.832e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 PAPD4-202ENST00000423041 3223 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.897e-12■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 RACGAP1-201ENST00000312377 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.922e-6■■■□□ 14.9
Retrieved 100 of 14,326 protein–RNA pairs in 369.1 ms