Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC20Q12834 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms