Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX7O95931 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CBX7O95931 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CBX7O95931 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CBX7O95931 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX7O95931 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX7O95931 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX7O95931 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX7O95931 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX7O95931 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX7O95931 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX7O95931 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX7O95931 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX7O95931 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX7O95931 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX7O95931 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms