Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD5O60279 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD5O60279 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms